Le Comité Syndical est l'organe délibérant. Il est composé de 44 délégués élus par les Syndicats Intercommunaux d'Alimentation en Eau Potable, membres de Vendée Eau. Ils se réunissent au moins trois fois par an.
Le Comité Syndical décide des grandes orientations du Service Public de l'eau potable et des investissements à réaliser.
Il vote chaque année le budget et fixe le prix de l'eau potable et des services.
Les membres du Bureau sont élus par le Comité Syndical.
Le Bureau se réunit 8 à 10 fois par an pour exercer les délégations qui lui ont été confiées par le Comité Syndical et élaborer les dossiers présentés à la délibération de l'Assemblée Générale.
Suite aux élections lors de l'Assemblée Générale constitutive de Vendée Eau, le 30 juin 2011, les membres du Bureau sont les Présidents des 11 Syndicats Intercommunaux.
Présidents des SIAEP et membres du bureau