Le Comité Syndical de Vendée Eau sera composé de 46 membres désignés par les communautés de communes et d'agglomération de Vendée.
Vendée Eau met également en place 8 Conseils Locaux, dans lesquels chaque commune est représentée. Ces commissions consultatives rendent des avis sur tous les sujets de la politique locale de l'eau et sont des relais d'information avec les territoires et l'abonné.